Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fpr-s1O08790 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fpr-s1O08790 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fpr-s1O08790 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fpr-s1O08790 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fpr-s1O08790 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fpr-s1O08790 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fpr-s1O08790 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fpr-s1O08790 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fpr-s1O08790 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fpr-s1O08790 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fpr-s1O08790 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fpr-s1O08790 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fpr-s1O08790 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fpr-s1O08790 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fpr-s1O08790 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fpr-s1O08790 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fpr-s1O08790 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fpr-s1O08790 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fpr-s1O08790 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fpr-s1O08790 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fpr-s1O08790 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fpr-s1O08790 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fpr-s1O08790 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fpr-s1O08790 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fpr-s1O08790 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fpr-s1O08790 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fpr-s1O08790 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fpr-s1O08790 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fpr-s1O08790 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fpr-s1O08790 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fpr-s1O08790 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fpr-s1O08790 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fpr-s1O08790 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fpr-s1O08790 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fpr-s1O08790 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fpr-s1O08790 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms