Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp6O08738 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp6O08738 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp6O08738 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp6O08738 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp6O08738 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp6O08738 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp6O08738 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp6O08738 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp6O08738 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp6O08738 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Casp6O08738 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp6O08738 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp6O08738 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casp6O08738 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp6O08738 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp6O08738 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Casp6O08738 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp6O08738 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casp6O08738 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp6O08738 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casp6O08738 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp6O08738 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp6O08738 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp6O08738 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp6O08738 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casp6O08738 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp6O08738 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp6O08738 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp6O08738 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casp6O08738 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp6O08738 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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