Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Usp35M0QWN7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Usp35M0QWN7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Usp35M0QWN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Usp35M0QWN7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Usp35M0QWN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Usp35M0QWN7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Usp35M0QWN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Usp35M0QWN7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Usp35M0QWN7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Usp35M0QWN7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Usp35M0QWN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Usp35M0QWN7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Usp35M0QWN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Usp35M0QWN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Usp35M0QWN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Usp35M0QWN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Usp35M0QWN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Usp35M0QWN7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Usp35M0QWN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Usp35M0QWN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Usp35M0QWN7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Usp35M0QWN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Usp35M0QWN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Usp35M0QWN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Usp35M0QWN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,83
Usp35M0QWN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Usp35M0QWN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Usp35M0QWN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Usp35M0QWN7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Usp35M0QWN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Usp35M0QWN7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Usp35M0QWN7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,4 ms