Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp35M0QWN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp35M0QWN7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp35M0QWN7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp35M0QWN7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp35M0QWN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp35M0QWN7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp35M0QWN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp35M0QWN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp35M0QWN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp35M0QWN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp35M0QWN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp35M0QWN7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp35M0QWN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp35M0QWN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp35M0QWN7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp35M0QWN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp35M0QWN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp35M0QWN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp35M0QWN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp35M0QWN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp35M0QWN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp35M0QWN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp35M0QWN7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp35M0QWN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp35M0QWN7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp35M0QWN7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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