Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ5

Cfap73, Cilia- and flagella-associated protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap73J3QPZ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cfap73J3QPZ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap73J3QPZ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap73J3QPZ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap73J3QPZ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap73J3QPZ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap73J3QPZ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap73J3QPZ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap73J3QPZ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap73J3QPZ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap73J3QPZ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cfap73J3QPZ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cfap73J3QPZ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap73J3QPZ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap73J3QPZ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cfap73J3QPZ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cfap73J3QPZ5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cfap73J3QPZ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap73J3QPZ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap73J3QPZ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap73J3QPZ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap73J3QPZ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap73J3QPZ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap73J3QPZ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap73J3QPZ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap73J3QPZ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap73J3QPZ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cfap73J3QPZ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap73J3QPZ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap73J3QPZ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap73J3QPZ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap73J3QPZ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap73J3QPZ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap73J3QPZ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap73J3QPZ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap73J3QPZ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap73J3QPZ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cfap73J3QPZ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfap73J3QPZ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfap73J3QPZ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfap73J3QPZ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap73J3QPZ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap73J3QPZ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap73J3QPZ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cfap73J3QPZ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfap73J3QPZ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfap73J3QPZ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cfap73J3QPZ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cfap73J3QPZ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms