Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8356J3QPD3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8356J3QPD3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8356J3QPD3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8356J3QPD3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8356J3QPD3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8356J3QPD3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8356J3QPD3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8356J3QPD3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm8356J3QPD3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8356J3QPD3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8356J3QPD3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8356J3QPD3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm8356J3QPD3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms