Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Smim22J3QP37 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26,09■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Smim22J3QP37 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Smim22J3QP37 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Smim22J3QP37 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Smim22J3QP37 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Smim22J3QP37 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Smim22J3QP37 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Smim22J3QP37 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Smim22J3QP37 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Smim22J3QP37 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Smim22J3QP37 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Smim22J3QP37 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Smim22J3QP37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Smim22J3QP37 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Smim22J3QP37 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Smim22J3QP37 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
Smim22J3QP37 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Smim22J3QP37 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Smim22J3QP37 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Smim22J3QP37 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Smim22J3QP37 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Smim22J3QP37 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Smim22J3QP37 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Smim22J3QP37 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Smim22J3QP37 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Smim22J3QP37 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Smim22J3QP37 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Smim22J3QP37 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Smim22J3QP37 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Smim22J3QP37 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Smim22J3QP37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Smim22J3QP37 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Smim22J3QP37 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Smim22J3QP37 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Smim22J3QP37 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Smim22J3QP37 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Smim22J3QP37 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Smim22J3QP37 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Smim22J3QP37 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Smim22J3QP37 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Smim22J3QP37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Smim22J3QP37 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Smim22J3QP37 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Smim22J3QP37 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Smim22J3QP37 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Smim22J3QP37 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Smim22J3QP37 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Smim22J3QP37 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Smim22J3QP37 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Smim22J3QP37 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Smim22J3QP37 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Smim22J3QP37 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Smim22J3QP37 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,3 ms