Protein–RNA interactions for Protein: G3UX18

Gm20726, Predicted gene, 20726, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20726G3UX18 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20726G3UX18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20726G3UX18 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20726G3UX18 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20726G3UX18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20726G3UX18 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20726G3UX18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms