Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Farp1F8VPU2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Farp1F8VPU2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Farp1F8VPU2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Farp1F8VPU2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Farp1F8VPU2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Farp1F8VPU2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Farp1F8VPU2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Farp1F8VPU2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Farp1F8VPU2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Farp1F8VPU2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp1F8VPU2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Farp1F8VPU2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Farp1F8VPU2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp1F8VPU2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp1F8VPU2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp1F8VPU2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Farp1F8VPU2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Farp1F8VPU2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Farp1F8VPU2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp1F8VPU2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp1F8VPU2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Farp1F8VPU2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Farp1F8VPU2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Farp1F8VPU2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Farp1F8VPU2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Farp1F8VPU2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Farp1F8VPU2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Farp1F8VPU2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Farp1F8VPU2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Farp1F8VPU2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Farp1F8VPU2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Farp1F8VPU2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Farp1F8VPU2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Farp1F8VPU2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Farp1F8VPU2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Farp1F8VPU2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Farp1F8VPU2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Farp1F8VPU2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Farp1F8VPU2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Farp1F8VPU2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Farp1F8VPU2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Farp1F8VPU2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Farp1F8VPU2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Farp1F8VPU2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Farp1F8VPU2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Farp1F8VPU2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Farp1F8VPU2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Farp1F8VPU2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Farp1F8VPU2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Farp1F8VPU2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Farp1F8VPU2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Farp1F8VPU2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Farp1F8VPU2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Farp1F8VPU2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Farp1F8VPU2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms