Protein–RNA interactions for Protein: F7CFJ3

Gm8232, Predicted gene 8232 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8232F7CFJ3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8232F7CFJ3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8232F7CFJ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8232F7CFJ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8232F7CFJ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8232F7CFJ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8232F7CFJ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8232F7CFJ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm8232F7CFJ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8232F7CFJ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8232F7CFJ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8232F7CFJ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8232F7CFJ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8232F7CFJ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8232F7CFJ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8232F7CFJ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8232F7CFJ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8232F7CFJ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8232F7CFJ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8232F7CFJ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8232F7CFJ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8232F7CFJ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8232F7CFJ3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms