Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm10378F6XQQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm10378F6XQQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10378F6XQQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10378F6XQQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm10378F6XQQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm10378F6XQQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm10378F6XQQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm10378F6XQQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm10378F6XQQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm10378F6XQQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm10378F6XQQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10378F6XQQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm10378F6XQQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10378F6XQQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm10378F6XQQ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10378F6XQQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10378F6XQQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm10378F6XQQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm10378F6XQQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10378F6XQQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10378F6XQQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10378F6XQQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10378F6XQQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gm10378F6XQQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm10378F6XQQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm10378F6XQQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm10378F6XQQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm10378F6XQQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm10378F6XQQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm10378F6XQQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm10378F6XQQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm10378F6XQQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm10378F6XQQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm10378F6XQQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm10378F6XQQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm10378F6XQQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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