Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21876F6XK35 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21876F6XK35 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm21876F6XK35 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21876F6XK35 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21876F6XK35 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21876F6XK35 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm21876F6XK35 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21876F6XK35 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21876F6XK35 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21876F6XK35 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21876F6XK35 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21876F6XK35 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm21876F6XK35 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21876F6XK35 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21876F6XK35 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21876F6XK35 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21876F6XK35 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21876F6XK35 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21876F6XK35 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21876F6XK35 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21876F6XK35 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21876F6XK35 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21876F6XK35 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21876F6XK35 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21876F6XK35 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms