Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp946F6VWU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp946F6VWU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp946F6VWU8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp946F6VWU8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp946F6VWU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp946F6VWU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp946F6VWU8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp946F6VWU8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp946F6VWU8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp946F6VWU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp946F6VWU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp946F6VWU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp946F6VWU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp946F6VWU8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp946F6VWU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp946F6VWU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp946F6VWU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp946F6VWU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp946F6VWU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp946F6VWU8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfp946F6VWU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp946F6VWU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp946F6VWU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp946F6VWU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp946F6VWU8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp946F6VWU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp946F6VWU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp946F6VWU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms