Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp988F6VKC7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp988F6VKC7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp988F6VKC7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp988F6VKC7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp988F6VKC7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp988F6VKC7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp988F6VKC7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp988F6VKC7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp988F6VKC7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp988F6VKC7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp988F6VKC7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp988F6VKC7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp988F6VKC7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp988F6VKC7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp988F6VKC7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp988F6VKC7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp988F6VKC7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp988F6VKC7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp988F6VKC7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp988F6VKC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp988F6VKC7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp988F6VKC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp988F6VKC7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp988F6VKC7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms