Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C2cd2E9Q3C1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2cd2E9Q3C1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2cd2E9Q3C1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C2cd2E9Q3C1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C2cd2E9Q3C1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2cd2E9Q3C1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2cd2E9Q3C1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2cd2E9Q3C1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2cd2E9Q3C1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2cd2E9Q3C1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2cd2E9Q3C1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2cd2E9Q3C1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2cd2E9Q3C1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2cd2E9Q3C1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C2cd2E9Q3C1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2cd2E9Q3C1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2cd2E9Q3C1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2cd2E9Q3C1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2cd2E9Q3C1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2cd2E9Q3C1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2cd2E9Q3C1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2cd2E9Q3C1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2cd2E9Q3C1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2cd2E9Q3C1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2cd2E9Q3C1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2cd2E9Q3C1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2cd2E9Q3C1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2cd2E9Q3C1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2cd2E9Q3C1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2cd2E9Q3C1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C2cd2E9Q3C1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C2cd2E9Q3C1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C2cd2E9Q3C1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2cd2E9Q3C1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2cd2E9Q3C1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2cd2E9Q3C1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2cd2E9Q3C1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2cd2E9Q3C1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2cd2E9Q3C1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2cd2E9Q3C1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2cd2E9Q3C1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2cd2E9Q3C1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2cd2E9Q3C1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2cd2E9Q3C1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2cd2E9Q3C1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
C2cd2E9Q3C1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms