Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt90E9Q1Z0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt90E9Q1Z0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt90E9Q1Z0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt90E9Q1Z0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt90E9Q1Z0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt90E9Q1Z0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt90E9Q1Z0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt90E9Q1Z0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt90E9Q1Z0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt90E9Q1Z0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt90E9Q1Z0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt90E9Q1Z0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt90E9Q1Z0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt90E9Q1Z0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt90E9Q1Z0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt90E9Q1Z0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt90E9Q1Z0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt90E9Q1Z0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt90E9Q1Z0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt90E9Q1Z0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt90E9Q1Z0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt90E9Q1Z0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt90E9Q1Z0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt90E9Q1Z0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt90E9Q1Z0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt90E9Q1Z0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt90E9Q1Z0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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