Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp558E9Q1J0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp558E9Q1J0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp558E9Q1J0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp558E9Q1J0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp558E9Q1J0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp558E9Q1J0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp558E9Q1J0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp558E9Q1J0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp558E9Q1J0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp558E9Q1J0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp558E9Q1J0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp558E9Q1J0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
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