Protein–RNA interactions for Protein: E9PXJ7

Gm20458, Predicted gene 20458, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20458E9PXJ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20458E9PXJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20458E9PXJ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20458E9PXJ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20458E9PXJ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20458E9PXJ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20458E9PXJ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20458E9PXJ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20458E9PXJ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20458E9PXJ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20458E9PXJ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20458E9PXJ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20458E9PXJ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20458E9PXJ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20458E9PXJ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20458E9PXJ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms