Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm6904E9PVF1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm6904E9PVF1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6904E9PVF1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm6904E9PVF1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm6904E9PVF1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6904E9PVF1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm6904E9PVF1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6904E9PVF1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6904E9PVF1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6904E9PVF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6904E9PVF1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6904E9PVF1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6904E9PVF1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6904E9PVF1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6904E9PVF1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6904E9PVF1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm6904E9PVF1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm6904E9PVF1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm6904E9PVF1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6904E9PVF1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6904E9PVF1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6904E9PVF1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6904E9PVF1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6904E9PVF1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6904E9PVF1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6904E9PVF1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6904E9PVF1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6904E9PVF1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6904E9PVF1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm6904E9PVF1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm6904E9PVF1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm6904E9PVF1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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