Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
SafbD3YXK2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
SafbD3YXK2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
SafbD3YXK2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
SafbD3YXK2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
SafbD3YXK2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
SafbD3YXK2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
SafbD3YXK2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
SafbD3YXK2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32,79■■■□□ 2,84
SafbD3YXK2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
SafbD3YXK2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
SafbD3YXK2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32,77■■■□□ 2,84
SafbD3YXK2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
SafbD3YXK2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
SafbD3YXK2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,83
SafbD3YXK2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
SafbD3YXK2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32,75■■■□□ 2,83
SafbD3YXK2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
SafbD3YXK2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32,73■■■□□ 2,83
SafbD3YXK2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32,73■■■□□ 2,83
SafbD3YXK2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
SafbD3YXK2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
SafbD3YXK2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,7■■■□□ 2,83
SafbD3YXK2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32,64■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
SafbD3YXK2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
SafbD3YXK2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
SafbD3YXK2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
SafbD3YXK2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
SafbD3YXK2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
SafbD3YXK2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
SafbD3YXK2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,59■■■□□ 2,81
SafbD3YXK2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
SafbD3YXK2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32,58■■■□□ 2,81
SafbD3YXK2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
SafbD3YXK2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
SafbD3YXK2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
SafbD3YXK2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
SafbD3YXK2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32,51■■■□□ 2,79
SafbD3YXK2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
SafbD3YXK2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
SafbD3YXK2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
SafbD3YXK2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
SafbD3YXK2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
SafbD3YXK2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32,46■■■□□ 2,79
SafbD3YXK2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,45■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,44■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32,44■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,44■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
SafbD3YXK2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
SafbD3YXK2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
SafbD3YXK2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
SafbD3YXK2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
SafbD3YXK2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
SafbD3YXK2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
SafbD3YXK2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
SafbD3YXK2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
SafbD3YXK2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
SafbD3YXK2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
SafbD3YXK2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
SafbD3YXK2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
SafbD3YXK2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
SafbD3YXK2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
SafbD3YXK2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,29■■■□□ 2,76
SafbD3YXK2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,29■■■□□ 2,76
SafbD3YXK2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,28■■■□□ 2,76
SafbD3YXK2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
SafbD3YXK2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
SafbD3YXK2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
SafbD3YXK2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
SafbD3YXK2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
SafbD3YXK2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32,24■■■□□ 2,75
SafbD3YXK2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
SafbD3YXK2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
SafbD3YXK2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
SafbD3YXK2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,19■■■□□ 2,74
SafbD3YXK2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
SafbD3YXK2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32,14■■■□□ 2,74
SafbD3YXK2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
SafbD3YXK2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
SafbD3YXK2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
SafbD3YXK2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
SafbD3YXK2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms