Protein–RNA interactions for Protein: D3YUG0

Samd13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd13D3YUG0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samd13D3YUG0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd13D3YUG0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd13D3YUG0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd13D3YUG0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd13D3YUG0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd13D3YUG0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd13D3YUG0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd13D3YUG0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd13D3YUG0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd13D3YUG0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd13D3YUG0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd13D3YUG0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd13D3YUG0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd13D3YUG0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms