Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CatipB9EKE5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CatipB9EKE5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CatipB9EKE5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CatipB9EKE5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CatipB9EKE5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CatipB9EKE5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CatipB9EKE5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CatipB9EKE5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CatipB9EKE5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CatipB9EKE5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CatipB9EKE5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CatipB9EKE5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CatipB9EKE5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CatipB9EKE5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CatipB9EKE5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CatipB9EKE5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CatipB9EKE5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CatipB9EKE5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CatipB9EKE5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CatipB9EKE5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CatipB9EKE5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CatipB9EKE5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CatipB9EKE5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CatipB9EKE5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CatipB9EKE5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CatipB9EKE5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CatipB9EKE5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CatipB9EKE5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CatipB9EKE5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CatipB9EKE5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CatipB9EKE5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CatipB9EKE5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CatipB9EKE5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CatipB9EKE5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CatipB9EKE5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CatipB9EKE5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CatipB9EKE5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CatipB9EKE5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CatipB9EKE5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CatipB9EKE5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CatipB9EKE5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CatipB9EKE5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CatipB9EKE5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CatipB9EKE5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CatipB9EKE5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CatipB9EKE5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CatipB9EKE5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CatipB9EKE5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CatipB9EKE5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CatipB9EKE5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CatipB9EKE5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CatipB9EKE5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CatipB9EKE5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CatipB9EKE5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CatipB9EKE5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CatipB9EKE5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CatipB9EKE5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CatipB9EKE5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CatipB9EKE5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CatipB9EKE5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CatipB9EKE5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CatipB9EKE5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CatipB9EKE5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CatipB9EKE5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CatipB9EKE5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CatipB9EKE5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CatipB9EKE5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CatipB9EKE5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CatipB9EKE5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CatipB9EKE5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CatipB9EKE5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CatipB9EKE5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CatipB9EKE5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CatipB9EKE5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CatipB9EKE5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CatipB9EKE5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CatipB9EKE5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CatipB9EKE5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CatipB9EKE5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms