Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Syce3B5KM66 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Syce3B5KM66 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Syce3B5KM66 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Syce3B5KM66 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Syce3B5KM66 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Syce3B5KM66 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Syce3B5KM66 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Syce3B5KM66 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Syce3B5KM66 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Syce3B5KM66 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Syce3B5KM66 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Syce3B5KM66 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Syce3B5KM66 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Syce3B5KM66 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Syce3B5KM66 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syce3B5KM66 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syce3B5KM66 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syce3B5KM66 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Syce3B5KM66 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Syce3B5KM66 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Syce3B5KM66 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Syce3B5KM66 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syce3B5KM66 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syce3B5KM66 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syce3B5KM66 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syce3B5KM66 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syce3B5KM66 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syce3B5KM66 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syce3B5KM66 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Syce3B5KM66 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Syce3B5KM66 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Syce3B5KM66 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Syce3B5KM66 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms