Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc22a28B2RT89 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc22a28B2RT89 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a28B2RT89 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a28B2RT89 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a28B2RT89 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a28B2RT89 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a28B2RT89 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc22a28B2RT89 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc22a28B2RT89 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc22a28B2RT89 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a28B2RT89 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a28B2RT89 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc22a28B2RT89 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc22a28B2RT89 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc22a28B2RT89 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a28B2RT89 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc22a28B2RT89 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc22a28B2RT89 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc22a28B2RT89 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc22a28B2RT89 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc22a28B2RT89 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc22a28B2RT89 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc22a28B2RT89 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc22a28B2RT89 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc22a28B2RT89 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms