Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll11A4Q9F4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll11A4Q9F4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttll11A4Q9F4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll11A4Q9F4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttll11A4Q9F4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll11A4Q9F4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll11A4Q9F4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttll11A4Q9F4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttll11A4Q9F4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttll11A4Q9F4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttll11A4Q9F4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttll11A4Q9F4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttll11A4Q9F4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll11A4Q9F4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttll11A4Q9F4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttll11A4Q9F4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttll11A4Q9F4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll11A4Q9F4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll11A4Q9F4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll11A4Q9F4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll11A4Q9F4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll11A4Q9F4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll11A4Q9F4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll11A4Q9F4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll11A4Q9F4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll11A4Q9F4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll11A4Q9F4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll11A4Q9F4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttll11A4Q9F4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll11A4Q9F4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll11A4Q9F4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll11A4Q9F4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttll11A4Q9F4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttll11A4Q9F4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.3 ms