Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhbdl2A2AGA4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhbdl2A2AGA4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl2A2AGA4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhbdl2A2AGA4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhbdl2A2AGA4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhbdl2A2AGA4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhbdl2A2AGA4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhbdl2A2AGA4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhbdl2A2AGA4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhbdl2A2AGA4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl2A2AGA4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl2A2AGA4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhbdl2A2AGA4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms