Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Nup62clA2AG10 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Nup62clA2AG10 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nup62clA2AG10 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nup62clA2AG10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nup62clA2AG10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nup62clA2AG10 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nup62clA2AG10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nup62clA2AG10 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nup62clA2AG10 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Nup62clA2AG10 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Nup62clA2AG10 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nup62clA2AG10 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nup62clA2AG10 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nup62clA2AG10 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nup62clA2AG10 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nup62clA2AG10 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nup62clA2AG10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nup62clA2AG10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nup62clA2AG10 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nup62clA2AG10 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nup62clA2AG10 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nup62clA2AG10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Nup62clA2AG10 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Nup62clA2AG10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Nup62clA2AG10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Nup62clA2AG10 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Nup62clA2AG10 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Nup62clA2AG10 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Nup62clA2AG10 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Nup62clA2AG10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Nup62clA2AG10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Nup62clA2AG10 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Nup62clA2AG10 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Nup62clA2AG10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Nup62clA2AG10 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Nup62clA2AG10 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Nup62clA2AG10 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Nup62clA2AG10 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Nup62clA2AG10 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Nup62clA2AG10 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Nup62clA2AG10 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Nup62clA2AG10 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Nup62clA2AG10 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Nup62clA2AG10 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Nup62clA2AG10 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Nup62clA2AG10 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Nup62clA2AG10 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Nup62clA2AG10 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms