Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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