Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21,5■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21,47■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21,45■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21,43■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21,33■■□□□ 1,01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,32■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21,32■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21,28■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21,07■□□□□ 0,96
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms