Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC034090A0A087WP46 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BC034090A0A087WP46 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC034090A0A087WP46 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC034090A0A087WP46 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BC034090A0A087WP46 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC034090A0A087WP46 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC034090A0A087WP46 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BC034090A0A087WP46 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BC034090A0A087WP46 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC034090A0A087WP46 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BC034090A0A087WP46 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC034090A0A087WP46 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BC034090A0A087WP46 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC034090A0A087WP46 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC034090A0A087WP46 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC034090A0A087WP46 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BC034090A0A087WP46 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC034090A0A087WP46 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC034090A0A087WP46 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC034090A0A087WP46 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC034090A0A087WP46 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC034090A0A087WP46 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC034090A0A087WP46 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC034090A0A087WP46 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC034090A0A087WP46 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC034090A0A087WP46 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC034090A0A087WP46 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC034090A0A087WP46 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC034090A0A087WP46 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC034090A0A087WP46 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BC034090A0A087WP46 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BC034090A0A087WP46 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BC034090A0A087WP46 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BC034090A0A087WP46 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BC034090A0A087WP46 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BC034090A0A087WP46 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC034090A0A087WP46 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC034090A0A087WP46 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC034090A0A087WP46 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC034090A0A087WP46 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BC034090A0A087WP46 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BC034090A0A087WP46 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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