Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28510A0A087WP28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm28510A0A087WP28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm28510A0A087WP28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28510A0A087WP28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm28510A0A087WP28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm28510A0A087WP28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm28510A0A087WP28 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm28510A0A087WP28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gm28510A0A087WP28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gm28510A0A087WP28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm28510A0A087WP28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm28510A0A087WP28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm28510A0A087WP28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm28510A0A087WP28 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm28510A0A087WP28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm28510A0A087WP28 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm28510A0A087WP28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm28510A0A087WP28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm28510A0A087WP28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm28510A0A087WP28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm28510A0A087WP28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm28510A0A087WP28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm28510A0A087WP28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28510A0A087WP28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28510A0A087WP28 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28510A0A087WP28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm28510A0A087WP28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm28510A0A087WP28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm28510A0A087WP28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28510A0A087WP28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28510A0A087WP28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm28510A0A087WP28 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28510A0A087WP28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28510A0A087WP28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28510A0A087WP28 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28510A0A087WP28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28510A0A087WP28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28510A0A087WP28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28510A0A087WP28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28510A0A087WP28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28510A0A087WP28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28510A0A087WP28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28510A0A087WP28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms