Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsc22d3Q9Z2S7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsc22d3Q9Z2S7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms