Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd1Q9Z2E2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mbd1Q9Z2E2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms