Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mbd2Q9Z2E1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd2Q9Z2E1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms