Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VarsQ9Z1Q9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VarsQ9Z1Q9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.4 ms