Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms