Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Setbp1Q9Z180 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Setbp1Q9Z180 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Setbp1Q9Z180 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms