Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb6Q9Z0T9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb6Q9Z0T9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb6Q9Z0T9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb6Q9Z0T9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb6Q9Z0T9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb6Q9Z0T9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb6Q9Z0T9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb6Q9Z0T9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms