Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Extl3Q9WVL6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Extl3Q9WVL6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms