Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tusc2Q9WVF8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tusc2Q9WVF8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms