Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp1a4Q9WV27 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atp1a4Q9WV27 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp1a4Q9WV27 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms