Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lemd3Q9WU40 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lemd3Q9WU40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lemd3Q9WU40 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms