Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nrf1Q9WU00 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrf1Q9WU00 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms