Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PplQ9R269 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PplQ9R269 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PplQ9R269 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PplQ9R269 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PplQ9R269 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PplQ9R269 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms