Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sorbs3Q9R1Z8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sorbs3Q9R1Z8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms