Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trex2Q9R1A9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trex2Q9R1A9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms