Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn3Q9R1A3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn3Q9R1A3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms