Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc26a4Q9R155 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc26a4Q9R155 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc26a4Q9R155 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms