Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hsf4Q9R0L1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hsf4Q9R0L1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms