Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NrkQ9R0G8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NrkQ9R0G8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NrkQ9R0G8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms