Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms